38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2462 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2462  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  183  8e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000144431  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002068  hypothetical protein  60.47 
 
 		 87 aa  87.4  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000363608  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0041  hypothetical protein  44.44 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00381  hypothetical protein  58.14 
 
 		 87 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0044  hypothetical protein  44.44 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000193062  hitchhiker  0.00000102958 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3726  hypothetical protein  40.91 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00243512  hitchhiker  0.00809749 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0038  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000159242  hitchhiker  0.000533076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0036  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000153863  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0044  hypothetical protein  44.94 
 
 		 92 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000282672  normal  0.843809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0041  hypothetical protein  43.82 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000318858  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0040  protein of unknown function DUF1488  41.11 
 
 		 91 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00230269  unclonable  0.00000000000350952 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0033  hypothetical protein  41.11 
 
 		 91 aa  72  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000298861  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0041  hypothetical protein  41.11 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00282046  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0036  hypothetical protein  41.11 
 
 		 91 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0051156  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0048  hypothetical protein  44.05 
 
 		 87 aa  72  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00169454  normal  0.150477 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0040  hypothetical protein  41.11 
 
 		 91 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000215973  unclonable  0.0000087148 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0035  hypothetical protein  42.86 
 
 		 85 aa  62  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000637046  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3669  hypothetical protein  46.58 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00836834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3597  putative periplasmic protein  39.08 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000115268  normal  0.951119 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0053  hypothetical protein  37.21 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00250701  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3767  hypothetical protein  39.08 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00207623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3596  putative periplasmic protein  39.08 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000934197  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3712  hypothetical protein  39.08 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000180356  normal  0.0550435 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3704  hypothetical protein  37.93 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000244931  normal  0.014665 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0035  hypothetical protein  35.56 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0445  protein of unknown function DUF1488  37.35 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000417841  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0433  protein of unknown function DUF1488  35.56 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000933009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3762  hypothetical protein  35.56 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03082  hypothetical protein  35.56 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000257953  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3664  hypothetical protein  35.56 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221368  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0433  hypothetical protein  35.56 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000050563  normal  0.0164752 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3474  hypothetical protein  35.56 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000630828  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03131  hypothetical protein  35.56 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000147061  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0084  hypothetical protein  45.76 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.170525  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3783  hypothetical protein  34.48 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00232531  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3962  protein of unknown function DUF1488  36.78 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0051868  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3575  hypothetical protein  33.33 
 
 		 85 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000231665  normal  0.229207 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0362  protein of unknown function DUF1488  30.12 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.213184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>