12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1078 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1078  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  286  8e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.579163 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2128  hypothetical protein  96.32 
 
 		 136 aa  274  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4883  hypothetical protein  95.31 
 
 		 144 aa  259  6.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01906  conserved hypothetical protein  87.72 
 
 		 99 aa  103  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1392  hypothetical protein  33.86 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0342  hypothetical protein  37.61 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0556448  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3332  hypothetical protein  36.7 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0343  hypothetical protein  33.87 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.103903  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3333  hypothetical protein  33.06 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01907  conserved hypothetical protein  30.51 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01894  hypothetical protein  30.51 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2131  hypothetical protein  30.51 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>