12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2128 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2128  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  287  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1078  hypothetical protein  96.32 
 
 
135 aa  274  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.579163 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4883  hypothetical protein  96.12 
 
 
144 aa  261  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01906  conserved hypothetical protein  85.96 
 
 
99 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1392  hypothetical protein  33.86 
 
 
125 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3332  hypothetical protein  36.7 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3333  hypothetical protein  34.15 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0342  hypothetical protein  35.78 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0556448  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0343  hypothetical protein  33.06 
 
 
127 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.103903  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01907  conserved hypothetical protein  31.5 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01894  hypothetical protein  31.5 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2131  hypothetical protein  31.67 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>