21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4787 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4787  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  245  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03316  hypothetical protein  99.16 
 
 
119 aa  244  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03269  hypothetical protein  99.16 
 
 
119 aa  244  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3666  hypothetical protein  98.32 
 
 
119 aa  243  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3949  hypothetical protein  98.32 
 
 
119 aa  243  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3750  hypothetical protein  98.32 
 
 
119 aa  243  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0248  putative receptor  97.48 
 
 
119 aa  241  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3855  hypothetical protein  97.48 
 
 
119 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.906588  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0249  putative receptor  97.48 
 
 
119 aa  241  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3766  hypothetical protein  84.48 
 
 
123 aa  181  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3886  hypothetical protein  84.48 
 
 
123 aa  179  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3776  putative inner membrane protein  84.48 
 
 
123 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3843  hypothetical protein  83.62 
 
 
123 aa  177  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3945  hypothetical protein  82.76 
 
 
123 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.433579  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3871  putative receptor  69.49 
 
 
119 aa  168  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.226366  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0096  hypothetical protein  40.34 
 
 
119 aa  80.9  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3982  hypothetical protein  35.07 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0574  hypothetical protein  35.07 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0236  hypothetical protein  35.07 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.118882  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002130  hypothetical protein  27.03 
 
 
109 aa  47.8  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00290  hypothetical protein  25.89 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>