19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0096 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0096  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  243  6.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0249  putative receptor  41.18 
 
 		 119 aa  94  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3750  hypothetical protein  39.5 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03269  hypothetical protein  40.34 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4787  hypothetical protein  40.34 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3855  hypothetical protein  40.34 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.906588  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03316  hypothetical protein  40.34 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3949  hypothetical protein  40.34 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3666  hypothetical protein  40.34 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0248  putative receptor  39.5 
 
 		 119 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3982  hypothetical protein  38.81 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0574  hypothetical protein  38.81 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0236  hypothetical protein  38.81 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.118882  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3843  hypothetical protein  46.74 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3886  hypothetical protein  46.74 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3945  hypothetical protein  46.74 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.433579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3766  hypothetical protein  45.65 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3776  putative inner membrane protein  45.65 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3871  putative receptor  40.68 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.226366  normal  0.174069 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>