17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00290 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00290  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  226  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002130  hypothetical protein  92.66 
 
 
109 aa  213  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2380  hypothetical protein  65.14 
 
 
109 aa  149  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2909  hypothetical protein  58.72 
 
 
110 aa  147  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0249  putative receptor  29.73 
 
 
119 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3750  hypothetical protein  26.13 
 
 
119 aa  47  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03316  hypothetical protein  25.89 
 
 
119 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03269  hypothetical protein  25.89 
 
 
119 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3666  hypothetical protein  30 
 
 
119 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3949  hypothetical protein  30 
 
 
119 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3855  hypothetical protein  30 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.906588  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4787  hypothetical protein  25.89 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0248  putative receptor  29.73 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3843  hypothetical protein  30.53 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3945  hypothetical protein  30.53 
 
 
123 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.433579  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3886  hypothetical protein  29.47 
 
 
123 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3766  hypothetical protein  29.47 
 
 
123 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>