13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3245 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3245  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  652    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.569241  hitchhiker  0.00000917948 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3568  hypothetical protein  97.46 
 
 
315 aa  637    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.764401  hitchhiker  6.7239e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2937  hypothetical protein  96.83 
 
 
315 aa  633  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.23849  hitchhiker  0.0000000000000170811 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10008  ea22  52.41 
 
 
182 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0500514  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00708  hypothetical protein  52.41 
 
 
182 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0459504  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0370  hypothetical protein  44.26 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.950994  hitchhiker  0.000000000189369 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0275  hypothetical protein  44.17 
 
 
227 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2882  putative bacteriophage protein  74.51 
 
 
83 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000271329  normal  0.0532902 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1017  hypothetical protein  40.83 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284572 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1517  hypothetical protein  90 
 
 
145 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1166  hypothetical protein  86.67 
 
 
153 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000303592  hitchhiker  1.8062800000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2296  hypothetical protein  26.91 
 
 
245 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  hitchhiker  2.2862299999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1086  hypothetical protein  31.79 
 
 
174 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000856292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>