12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00708 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_10008  ea22  100 
 
 
182 aa  374  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0500514  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00708  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  374  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0459504  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2882  putative bacteriophage protein  92.31 
 
 
83 aa  145  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000271329  normal  0.0532902 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2937  hypothetical protein  53.79 
 
 
315 aa  124  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.23849  hitchhiker  0.0000000000000170811 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3568  hypothetical protein  53.1 
 
 
315 aa  124  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.764401  hitchhiker  6.7239e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3245  hypothetical protein  52.41 
 
 
315 aa  124  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.569241  hitchhiker  0.00000917948 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0370  hypothetical protein  54.46 
 
 
161 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.950994  hitchhiker  0.000000000189369 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0275  hypothetical protein  55.56 
 
 
227 aa  88.6  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1517  hypothetical protein  40.68 
 
 
145 aa  61.2  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1166  hypothetical protein  38.58 
 
 
153 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000303592  hitchhiker  1.8062800000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1017  hypothetical protein  53.85 
 
 
206 aa  56.6  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4058  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.97 
 
 
553 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.675174  normal  0.476931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>