20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3220 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3220  antitermination protein Q  100 
 
 		 144 aa  301  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0931001  hitchhiker  0.00440556 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00502  predicted antitermination protein  81.75 
 
 		 127 aa  217  5e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00507  hypothetical protein  81.75 
 
 		 127 aa  217  5e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0823  phage antitermination Q  81.75 
 
 		 127 aa  217  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.107592  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01522  hypothetical protein  82.5 
 
 		 125 aa  207  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1649  phage antitermination Q  82.5 
 
 		 125 aa  207  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000915979  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01528  antitermination protein Q-like protein from lambdoid prophage DLP12  82.5 
 
 		 126 aa  207  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.38987  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3538  antitermination protein  100 
 
 		 63 aa  130  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.112782  hitchhiker  0.000000119327 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2152  phage antitermination Q type 1 family  49.59 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828885  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2827  antitermination Q family protein  42.65 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2749  phage antitermination protein Q  42.65 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1457  phage antitermination protein Q  42.65 
 
 		 141 aa  115  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.36049  normal  0.814729 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2239  phage antitermination protein Q  44.8 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422487  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2176  antitermination protein Q  53.42 
 
 		 73 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.108852 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1214  hypothetical protein  29.23 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1160  phage antitermination Q type 1 family protein  79.49 
 
 		 41 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.403701 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2910  late antiterminator  32.91 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000906768  hitchhiker  0.0000000000646478 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1323  hypothetical protein  28.26 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106694  normal  0.60591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3952  hypothetical protein  28.26 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.300689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1025  putative antitermination protein  26.74 
 
 		 166 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0347786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>