18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01528 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01528  antitermination protein Q-like protein from lambdoid prophage DLP12  100 
 
 		 126 aa  260  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.38987  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01522  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1649  phage antitermination Q  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000915979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0823  phage antitermination Q  86.67 
 
 		 127 aa  217  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.107592  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00507  hypothetical protein  86.67 
 
 		 127 aa  217  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00502  predicted antitermination protein  86.67 
 
 		 127 aa  217  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238251  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3220  antitermination protein Q  82.5 
 
 		 144 aa  207  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0931001  hitchhiker  0.00440556 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2152  phage antitermination Q type 1 family  50.83 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828885  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2749  phage antitermination protein Q  41.67 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1457  phage antitermination protein Q  41.67 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.36049  normal  0.814729 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2827  antitermination Q family protein  41.67 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2239  phage antitermination protein Q  42.5 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422487  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2176  antitermination protein Q  47.83 
 
 		 73 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.108852 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1214  hypothetical protein  30.16 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3538  antitermination protein  71.79 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.112782  hitchhiker  0.000000119327 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1160  phage antitermination Q type 1 family protein  64.1 
 
 		 41 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.403701 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2910  late antiterminator  32.91 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000906768  hitchhiker  0.0000000000646478 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1323  hypothetical protein  27.97 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106694  normal  0.60591 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>