19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00502 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00502  predicted antitermination protein  100 
 
 		 127 aa  263  5e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00507  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  263  5e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0823  phage antitermination Q  100 
 
 		 127 aa  263  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.107592  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01528  antitermination protein Q-like protein from lambdoid prophage DLP12  86.67 
 
 		 126 aa  217  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.38987  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01522  hypothetical protein  86.67 
 
 		 125 aa  218  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1649  phage antitermination Q  86.67 
 
 		 125 aa  218  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000915979  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3220  antitermination protein Q  81.75 
 
 		 144 aa  217  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0931001  hitchhiker  0.00440556 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2152  phage antitermination Q type 1 family  51.67 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828885  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2749  phage antitermination protein Q  41.6 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1457  phage antitermination protein Q  41.6 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.36049  normal  0.814729 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2827  antitermination Q family protein  41.6 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2239  phage antitermination protein Q  43.33 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422487  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2176  antitermination protein Q  57.81 
 
 		 73 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.108852 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1160  phage antitermination Q type 1 family protein  77.5 
 
 		 41 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.403701 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3538  antitermination protein  66.67 
 
 		 63 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.112782  hitchhiker  0.000000119327 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1214  hypothetical protein  28.69 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2910  late antiterminator  30 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000906768  hitchhiker  0.0000000000646478 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1323  hypothetical protein  28.81 
 
 		 129 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106694  normal  0.60591 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1025  putative antitermination protein  28.26 
 
 		 166 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0347786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>