11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3219 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3219    100 
 
 		 153 bp  303  7.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410549  hitchhiker  0.00984076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3537    94.77 
 
 		 153 bp  240  9e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00162476  hitchhiker  0.000000296902 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1848  DNA methylase  95.5 
 
 		 1059 bp  180  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000193192  hitchhiker  0.0000000226376 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3151  DNA methylase  95.5 
 
 		 1059 bp  180  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000168176  hitchhiker  0.000000000119452 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2196  DNA methylase  92.59 
 
 		 1176 bp  151  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000872225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1767  DNA methylase  88.89 
 
 		 1059 bp  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000189808  hitchhiker  0.00347478 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1444  DNA methylase  93.33 
 
 		 1050 bp  109  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1263  DNA methylase  90 
 
 		 1050 bp  107  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00126419  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2150  DNA methylase  90 
 
 		 1050 bp  107  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209549  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1272  DNA methylase  90.67 
 
 		 1050 bp  93.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.342929  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1440  DNA methylase  91.43 
 
 		 1047 bp  46.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.294057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>