13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0920 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0920    100 
 
 		 135 bp  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.700008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1810    92.54 
 
 		 258 bp  93.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581958  hitchhiker  0.00000102188 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0005  IS1414, transposase  90.62 
 
 		 1209 bp  79.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682409  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1564  transposase  88.89 
 
 		 129 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376737 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2222  transposase, Mutator family  88.89 
 
 		 870 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00694083  hitchhiker  0.0000000000000060867 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0107  TnpA  86.79 
 
 		 123 bp  50.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0238  transposase mutator type  90 
 
 		 1209 bp  48.1  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1493  transposase mutator type  90 
 
 		 1209 bp  48.1  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2007  transposase mutator type  90 
 
 		 1209 bp  48.1  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.715039  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2356  transposase mutator type  90 
 
 		 1209 bp  48.1  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2179    96.15 
 
 		 1199 bp  44.1  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2073    96.15 
 
 		 1199 bp  44.1  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000839845  hitchhiker  0.0000707086 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2291  transposase  96.15 
 
 		 339 bp  44.1  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0059921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>