7 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01428 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_2186  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  235  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1651  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 443 aa  235  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01428  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  232  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1554  leucine-rich repeat-containing protein  99.1 
 
 		 443 aa  232  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.041299  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01440  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  232  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1704  hypothetical protein  92.79 
 
 		 418 aa  220  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2080  leucine-rich repeat protein  92.79 
 
 		 419 aa  220  6e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>