15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3139 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3139  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  295  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3866  hypothetical protein  97.92 
 
 		 144 aa  270  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.394277  normal  0.400825 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0553  hypothetical protein  47.86 
 
 		 148 aa  110  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0720  hypothetical protein  37.5 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0351  hypothetical protein  30.57 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0761391  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1354  putative signal peptide protein  40 
 
 		 209 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4283  hypothetical protein  27.33 
 
 		 206 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.911072  normal  0.0252106 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1638  putative signal peptide protein  36.26 
 
 		 245 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2334  hypothetical protein  30.83 
 
 		 206 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0633948  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1363  putative signal peptide protein  37.33 
 
 		 193 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1909  putative signal peptide protein  42.62 
 
 		 247 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.42684  normal  0.0790998 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0976  hypothetical protein  35.23 
 
 		 202 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1851  hypothetical protein  34.12 
 
 		 218 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388772  normal  0.0532446 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1580  putative signal peptide protein  40.98 
 
 		 247 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171314  normal  0.0540175 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1805  hypothetical protein  31.63 
 
 		 180 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.409746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>