12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0553 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0553  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  302  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3139  hypothetical protein  47.86 
 
 		 144 aa  110  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3866  hypothetical protein  48.72 
 
 		 144 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.394277  normal  0.400825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0720  hypothetical protein  39.13 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1354  putative signal peptide protein  31.11 
 
 		 209 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1363  putative signal peptide protein  30 
 
 		 193 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0351  hypothetical protein  26.28 
 
 		 190 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0761391  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2334  hypothetical protein  35.48 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0633948  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1851  hypothetical protein  35.48 
 
 		 218 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388772  normal  0.0532446 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4283  hypothetical protein  42.86 
 
 		 206 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.911072  normal  0.0252106 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1490  hypothetical protein  32.99 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0740119  normal  0.142837 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5079  hypothetical protein  34.78 
 
 		 180 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>