17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3866 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3866  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  294  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.394277  normal  0.400825 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3139  hypothetical protein  97.92 
 
 		 144 aa  290  5e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0553  hypothetical protein  48.72 
 
 		 148 aa  110  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0720  hypothetical protein  37.5 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0351  hypothetical protein  33.12 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0761391  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1354  putative signal peptide protein  38.67 
 
 		 209 aa  52.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4283  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.911072  normal  0.0252106 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2334  hypothetical protein  30.83 
 
 		 206 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0633948  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1638  putative signal peptide protein  35.16 
 
 		 245 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1363  putative signal peptide protein  36 
 
 		 193 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1851  hypothetical protein  34.12 
 
 		 218 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388772  normal  0.0532446 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0976  hypothetical protein  35.23 
 
 		 202 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1805  hypothetical protein  32.38 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.409746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1909  putative signal peptide protein  40.98 
 
 		 247 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.42684  normal  0.0790998 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1780  hypothetical protein  32.38 
 
 		 180 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.507226  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6299  hypothetical protein  32.38 
 
 		 180 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1580  putative signal peptide protein  39.34 
 
 		 247 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171314  normal  0.0540175 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>