23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0756 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0756  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  420  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144399  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2094  conserved transmembrane protein  65.09 
 
 		 226 aa  267  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2174  transmembrane protein  64.29 
 
 		 225 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5905  hypothetical protein  65.7 
 
 		 221 aa  246  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0089  hypothetical protein  61.9 
 
 		 225 aa  236  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.081156  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2622  hypothetical protein  63.68 
 
 		 221 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2493  hypothetical protein  63.38 
 
 		 221 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.998378 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1963  hypothetical protein  63.77 
 
 		 221 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2574  hypothetical protein  63.77 
 
 		 221 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2598  hypothetical protein  63.77 
 
 		 221 aa  215  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0723  hypothetical protein  61.84 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.174182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7221  hypothetical protein  43.08 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2983  hypothetical protein  37.5 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000560028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1020  hypothetical protein  38.54 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113619  normal  0.37406 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5040  hypothetical protein  35.14 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0337  hypothetical protein  41.83 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2870  hypothetical protein  33.99 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.922239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4188  hypothetical protein  33.5 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1370  hypothetical protein  35.04 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.73391  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0084  hypothetical protein  38.33 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6316  hypothetical protein  35.84 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1418  Gram-positive anchor  33.78 
 
 		 262 aa  61.6  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4926  hypothetical protein  34.48 
 
 		 268 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>