22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0089 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0089  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.081156  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2094  conserved transmembrane protein  79.64 
 
 		 226 aa  345  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2174  transmembrane protein  75.45 
 
 		 225 aa  335  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5905  hypothetical protein  73.02 
 
 		 221 aa  289  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2622  hypothetical protein  72.99 
 
 		 221 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2493  hypothetical protein  72.51 
 
 		 221 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.998378 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1963  hypothetical protein  73.46 
 
 		 221 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2574  hypothetical protein  73.46 
 
 		 221 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2598  hypothetical protein  73.46 
 
 		 221 aa  252  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0756  hypothetical protein  61.9 
 
 		 219 aa  241  7e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144399  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0723  hypothetical protein  67.61 
 
 		 225 aa  231  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.174182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7221  hypothetical protein  39.29 
 
 		 199 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2983  hypothetical protein  37.06 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000560028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1020  hypothetical protein  34.31 
 
 		 200 aa  98.6  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113619  normal  0.37406 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4188  hypothetical protein  36.06 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5040  hypothetical protein  35.05 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0337  hypothetical protein  39.81 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2870  hypothetical protein  34.27 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.922239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0084  hypothetical protein  39.55 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6316  hypothetical protein  40.46 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1370  hypothetical protein  34.09 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.73391  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1418  Gram-positive anchor  33.33 
 
 		 262 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>