13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2172 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2172  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00990541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  27.27 
 
 		 1009 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  26.97 
 
 		 1013 aa  50.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  30.72 
 
 		 935 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  25.62 
 
 		 755 aa  46.2  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0788  S-layer protein, peptidoglycan endo-beta-N-acetylglucosaminidase and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion  25.91 
 
 		 615 aa  45.8  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  0.00000000000000356588  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2560  S-layer domain protein  32.98 
 
 		 614 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  29.11 
 
 		 506 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1027  S-layer protein  25.32 
 
 		 219 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0927071  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23490  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000511503  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1282  putative S-layer protein  28 
 
 		 223 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1225  S-layer protein, putative  28 
 
 		 223 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2877  S-layer-like domain-containing protein  35.53 
 
 		 585 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>