More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1568 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1568  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  100 
 
 
187 aa  385  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0145639  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1775  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  68.11 
 
 
206 aa  268  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0907  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  66.31 
 
 
201 aa  262  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000149415  hitchhiker  0.00000000332325 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1190  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  66.84 
 
 
197 aa  259  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00563763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0784  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  59.04 
 
 
546 aa  255  3e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.919428  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0807  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  58.51 
 
 
546 aa  251  3e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0067  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  61.83 
 
 
192 aa  248  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1732  anthranilate synthase component II  62.57 
 
 
191 aa  246  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0070  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  60 
 
 
192 aa  246  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1341  anthranilate synthase, component II  60.96 
 
 
204 aa  245  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal  0.788179 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2468  anthranilate synthase component II  61.62 
 
 
188 aa  245  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0078  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  60 
 
 
195 aa  244  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000982059 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0069  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  59.46 
 
 
195 aa  243  9e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  59.46 
 
 
195 aa  243  9e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0069  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  59.46 
 
 
195 aa  243  9e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2224  anthranilate synthase component II  61.62 
 
 
189 aa  243  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.626919 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1028  anthranilate synthase component II  62.16 
 
 
195 aa  243  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  58.38 
 
 
195 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  58.38 
 
 
195 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0077  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  58.38 
 
 
195 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  58.92 
 
 
195 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0068  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  58.38 
 
 
195 aa  241  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1161  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  61.83 
 
 
193 aa  241  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.765276  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0081  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  58.38 
 
 
195 aa  241  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2496  anthranilate synthase component II  60.43 
 
 
189 aa  241  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0301629  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0583  anthranilate synthase component II  59.14 
 
 
190 aa  241  7e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4583  para-aminobenzoate synthase component II  60.32 
 
 
191 aa  240  9e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5239  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  57.84 
 
 
195 aa  239  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0752  anthranilate synthase, component II  58.42 
 
 
192 aa  238  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.425073 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2155  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  60.75 
 
 
188 aa  238  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64084  hitchhiker  0.0020762 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2564  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  60.75 
 
 
189 aa  238  5e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1061  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  57.07 
 
 
192 aa  237  6.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.124191 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0352  para-aminobenzoate synthase component II  59.46 
 
 
187 aa  237  6.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4670  para-aminobenzoate synthase component II  58.92 
 
 
187 aa  237  6.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.234421 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03211  para-aminobenzoate synthase component II  58.92 
 
 
187 aa  236  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242193  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0352  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  58.92 
 
 
187 aa  236  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365633  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03163  hypothetical protein  58.92 
 
 
187 aa  236  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363246  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3736  para-aminobenzoate synthase component II  58.29 
 
 
187 aa  236  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3557  para-aminobenzoate synthase component II  58.92 
 
 
187 aa  236  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3830  para-aminobenzoate synthase component II  58.92 
 
 
187 aa  236  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2382  anthranilate synthase component II  58.82 
 
 
190 aa  236  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.655324  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3477  anthranilate synthase component II  58.92 
 
 
190 aa  235  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.760643  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2261  anthranilate synthase component II  59.89 
 
 
189 aa  236  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3774  para-aminobenzoate synthase component II  60 
 
 
187 aa  235  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.587624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1454  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  60.22 
 
 
188 aa  235  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3642  para-aminobenzoate synthase component II  58.38 
 
 
187 aa  234  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000573837 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4581  anthranilate synthase component II  57.89 
 
 
199 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000148168  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2249  anthranilate synthase, component II  60.53 
 
 
192 aa  234  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.814755  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3837  para-aminobenzoate synthase component II  59.46 
 
 
187 aa  234  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1955  anthranilate synthase component II  59.36 
 
 
189 aa  234  6e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3666  para-aminobenzoate synthase component II  59.46 
 
 
187 aa  234  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.344721  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3518  anthranilate synthase component II  56.84 
 
 
192 aa  234  7e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.934173  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2711  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  58.33 
 
 
196 aa  234  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2845  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  60 
 
 
190 aa  233  8e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101069  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0201  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  57.98 
 
 
200 aa  233  8e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0731  anthranilate synthase component II  58.29 
 
 
188 aa  234  8e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3244  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase component II  60 
 
 
190 aa  233  8e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349554  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2543  anthranilate synthase component II  57.75 
 
 
195 aa  234  8e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.362783  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0460  anthranilate synthase component II  56.76 
 
 
200 aa  233  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2361  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  62.11 
 
 
197 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.853565  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3024  anthranilate synthase component II  55.68 
 
 
205 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00296432  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2037  anthranilate synthase component II  60.43 
 
 
187 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2585  anthranilate synthase component II  59.26 
 
 
195 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0284  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  59.16 
 
 
191 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3787  para-aminobenzoate synthase component II  57.84 
 
 
187 aa  232  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536724 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3497  anthranilate synthase component II  56.22 
 
 
200 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.317495  hitchhiker  0.000454644 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1121  anthranilate synthase, component II  57.75 
 
 
187 aa  233  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0241501  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3666  para-aminobenzoate synthase component II  58.92 
 
 
187 aa  232  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11794  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1581  anthranilate synthase component II  58.92 
 
 
191 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1254  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  58.29 
 
 
198 aa  231  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4034  para-aminobenzoate synthase component II  56.02 
 
 
238 aa  231  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3740  para-aminobenzoate synthase component II  58.38 
 
 
187 aa  231  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.780045  decreased coverage  0.00646888 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1868  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  55.08 
 
 
195 aa  231  6e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3855  para-aminobenzoate synthase component II  56.02 
 
 
191 aa  231  6e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0358  anthranilate synthase component II  58.15 
 
 
190 aa  230  8.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2048  anthranilate synthase component II  60.96 
 
 
187 aa  230  8.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0195497  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2861  anthranilate synthase component II  56.76 
 
 
195 aa  230  9e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2699  anthranilate synthase component II  55.68 
 
 
195 aa  230  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0505  anthranilate synthase component II  56.22 
 
 
199 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.624854 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2572  anthranilate synthase component II  56.22 
 
 
199 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0462  anthranilate synthase component II  56.22 
 
 
199 aa  229  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.431343 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0438  anthranilate synthase component II  56.22 
 
 
199 aa  229  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0533  anthranilate synthase component II  56.22 
 
 
199 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3652  anthranilate synthase component II  59.57 
 
 
194 aa  230  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5115  anthranilate synthase component II  57.89 
 
 
197 aa  229  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3620  anthranilate synthase component II  55.68 
 
 
196 aa  229  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2910  anthranilate synthase component II  56.76 
 
 
196 aa  229  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0147  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  56.76 
 
 
188 aa  229  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3179  anthranilate synthase component II  55.14 
 
 
189 aa  229  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4187  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  54.01 
 
 
199 aa  229  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0450  anthranilate synthase component II  57.37 
 
 
197 aa  228  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.401641 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0532  anthranilate synthase component II  56.76 
 
 
196 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0526  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  57.89 
 
 
202 aa  228  3e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3576  anthranilate synthase component II  56.76 
 
 
196 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455371  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4993  anthranilate synthase glutamine amidotransferase  58.33 
 
 
199 aa  228  3e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.565784  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0158  anthranilate synthase component II  56.84 
 
 
194 aa  228  3e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.965467  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4455  anthranilate synthase component II  58.7 
 
 
190 aa  228  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0645  anthranilate synthase component II  56.76 
 
 
196 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0941  anthranilate synthase component II  56.76 
 
 
196 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3584  anthranilate synthase component II  56.76 
 
 
196 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>