32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_355 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_355  dephospho-CoA kinase  100 
 
 		 183 aa  369  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.113418  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0412  hypothetical protein  95.63 
 
 		 183 aa  357  4e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.309428  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0391  dephospho-CoA kinase-like protein  93.96 
 
 		 183 aa  350  5.9999999999999994e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0813  hypothetical protein  32.97 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00430101  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1392  hypothetical protein  34.62 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0311  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  86.3  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.677562  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0527  hypothetical protein  31.75 
 
 		 183 aa  85.5  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.986919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0937  hypothetical protein  32.6 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0694  dephospho-CoA kinase  34.16 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.202275  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0592  hypothetical protein  34.55 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1556  hypothetical protein  30.77 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0764145  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0975  hypothetical protein  35.71 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1593  hypothetical protein  29.94 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2091  adenylate kinase  30.56 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0585864  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1975  hypothetical protein  29.57 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.471384 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0594  adenylate kinase  31.84 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1657  adenylate kinase, conjectural  29.78 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.160746  hitchhiker  0.0066831 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1363  hypothetical protein  29.21 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000000906379  hitchhiker  0.0000000219103 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1999  dephospho-CoA kinase  29.71 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1012  hypothetical protein  31.18 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.720954  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1857  dephospho-CoA kinase  32.21 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.201753 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0266  Dephospho-CoA kinase-like protein  31.5 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1986  adenylate kinase, conjectural  28.9 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.975431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1714  hypothetical protein  32.2 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.992026  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2012  adenylate kinase related protein (AdkA-like)  26.97 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1265  adenylate kinase  32.8 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60062 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1799  adenylate kinase  26.26 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2153  hypothetical protein  30.51 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000173574  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0684  adenylate kinase, conjectural  26.97 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0979482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1786  dephospho-CoA kinase-like protein  29.14 
 
 		 167 aa  50.8  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1780  dephospho-CoA kinase, CoaE  25.47 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0627  ABC transporter related  28.12 
 
 		 266 aa  41.2  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>