31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0412 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0412  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  367  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.309428  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_355  dephospho-CoA kinase  95.63 
 
 
183 aa  357  4e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.113418  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0391  dephospho-CoA kinase-like protein  93.96 
 
 
183 aa  351  4e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0813  hypothetical protein  33.51 
 
 
188 aa  92.8  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00430101  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1392  hypothetical protein  34.62 
 
 
183 aa  88.6  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0311  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  87  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.677562  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0527  hypothetical protein  31.75 
 
 
183 aa  85.1  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.986919  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0694  dephospho-CoA kinase  34.16 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.202275  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1556  hypothetical protein  32.97 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0764145  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0592  hypothetical protein  35.15 
 
 
185 aa  79  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0937  hypothetical protein  30.39 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1593  hypothetical protein  30.51 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0975  hypothetical protein  34.92 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1363  hypothetical protein  31.46 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000000906379  hitchhiker  0.0000000219103 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1657  adenylate kinase, conjectural  30.9 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.160746  hitchhiker  0.0066831 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1975  hypothetical protein  29.57 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.471384 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0594  adenylate kinase  31.28 
 
 
167 aa  67.4  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1999  dephospho-CoA kinase  29.14 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2091  adenylate kinase  28.18 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0585864  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1012  hypothetical protein  31.18 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.720954  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1857  dephospho-CoA kinase  31.54 
 
 
206 aa  62.4  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.201753 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1714  hypothetical protein  32.2 
 
 
173 aa  61.6  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.992026  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1986  adenylate kinase, conjectural  28.32 
 
 
170 aa  61.6  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.975431  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0266  Dephospho-CoA kinase-like protein  29.13 
 
 
198 aa  60.5  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2012  adenylate kinase related protein (AdkA-like)  26.4 
 
 
188 aa  58.9  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1799  adenylate kinase  25.14 
 
 
218 aa  57.8  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2153  hypothetical protein  28.81 
 
 
171 aa  55.8  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000173574  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1265  adenylate kinase  31.2 
 
 
216 aa  55.1  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.60062 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0684  adenylate kinase, conjectural  27.93 
 
 
170 aa  54.7  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0979482  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1780  dephospho-CoA kinase, CoaE  28.57 
 
 
197 aa  53.9  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1786  dephospho-CoA kinase-like protein  29.71 
 
 
167 aa  51.6  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>