49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2448 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2448  transposase, IS4  100 
 
 
232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.506869  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2763  transposase, IS4  96.98 
 
 
363 aa  459  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.679424  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2793  transposase, IS4  97.41 
 
 
363 aa  459  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2797  transposase, IS4  97.41 
 
 
363 aa  459  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2805  transposase, IS4  97.84 
 
 
237 aa  459  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3088  transposase IS4 family protein  94.4 
 
 
363 aa  449  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2430  transposase, IS4  67.53 
 
 
363 aa  310  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2205  transposase, IS4  67.53 
 
 
363 aa  310  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2108  transposase, IS4  67.53 
 
 
363 aa  310  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.958109 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0925  transposase, IS4  67.53 
 
 
363 aa  310  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.310658  normal  0.553314 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0308  transposase, IS4  67.53 
 
 
363 aa  310  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2823  transposase, IS4  67.53 
 
 
363 aa  310  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2659  transposase, IS4  67.53 
 
 
363 aa  310  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0464  transposase, IS4  67.53 
 
 
363 aa  310  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0293358  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1807  transposase, IS4  67.53 
 
 
333 aa  309  2e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.911781  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1702  transposase, IS4  66.67 
 
 
363 aa  305  4.0000000000000004e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2301  hypothetical protein  67.36 
 
 
281 aa  202  4e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0211  hypothetical protein  26.09 
 
 
184 aa  62  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0705  transposase IS4 family protein  24.64 
 
 
395 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2690  transposase IS4 family protein  25.59 
 
 
391 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0317  transposase IS4 family protein  25.12 
 
 
395 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1670  transposase IS4 family protein  25.26 
 
 
374 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2377  transposase IS4 family protein  22.71 
 
 
395 aa  55.8  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0202  transposase IS4 family protein  22.71 
 
 
395 aa  55.8  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1561  transposase IS4 family protein  22.71 
 
 
395 aa  55.8  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1684  transposase IS4 family protein  22.71 
 
 
395 aa  55.8  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0432  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
395 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.931638  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2824  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
395 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2707  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
395 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000168624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2180  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
395 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000421211  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0079  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
395 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000349204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0225  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
395 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.006695  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0252  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
395 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.566728  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0331  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
395 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000268151  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0408  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
395 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0817  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
395 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.209477  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1498  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
395 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000398199  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2681  transposase IS4 family protein  24.51 
 
 
393 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000123658  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1163  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
395 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1394  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
395 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0328  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
395 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2152  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
395 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2937  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
395 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3596  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
395 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000661029  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1926  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
395 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3280  transposase IS4 family protein  22.17 
 
 
395 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3379  transposase IS4 family protein  22.17 
 
 
395 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3566  transposase IS4 family protein  22.17 
 
 
395 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5056  hypothetical protein  34.25 
 
 
94 aa  45.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0568067  normal  0.243537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>