47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1773 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1773  NrdI  100 
 
 		 92 aa  188  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.524492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0970  NrdI protein  37.18 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0771  ribonucleotide reductase stimulatory protein  38.27 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0754  ribonucleotide reductase stimulatory protein  38.27 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.493486  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0396  ribonucleotide reductase stimulatory protein  40 
 
 		 132 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1404  ribonucleotide reductase stimulatory protein  31.65 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00373204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3939  ribonucleotide reductase stimulatory protein  31.65 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00138994  normal  0.102408 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1440  ribonucleotide reductase stimulatory protein  31.65 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000010796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1369  ribonucleotide reductase stimulatory protein  31.65 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1508  ribonucleotide reductase stimulatory protein  31.65 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000012533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1241  ribonucleotide reductase stimulatory protein  31.65 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.858034  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1267  ribonucleotide reductase stimulatory protein  31.65 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129347  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1239  ribonucleotide reductase stimulatory protein  31.65 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.316696  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1266  ribonucleotide reductase stimulatory protein  31.65 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1469  ribonucleotide reductase stimulatory protein  31.65 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0534212  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1073  ribonucleotide reductase stimulatory protein  31.17 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.882937  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0192  ribonucleotide reductase stimulatory protein  30.26 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.171913  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2766  NrdI protein  32.86 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0540  NrdI protein  32.05 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1515  nrdI protein  32.93 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000118726  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3414  hypothetical protein  43.66 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0441882  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3234  Ribonucleotide reductase large subunit domain protein  43.66 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.177065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2955  ribonucleotide reductase stimulatory protein  35.21 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02530  hypothetical protein  35.21 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2810  ribonucleotide reductase stimulatory protein  35.21 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4376  ribonucleotide reductase stimulatory protein  32.86 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1032  ribonucleotide reductase stimulatory protein  35.21 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2796  ribonucleotide reductase stimulatory protein  35.21 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0122492 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3205  ribonucleotide reductase stimulatory protein  35.21 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1009  NrdI protein  35.21 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.413651  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02494  hypothetical protein  35.21 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3918  ribonucleotide reductase stimulatory protein  35.21 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0782366 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl529  ribonucleotide reductase stimulatory protein  28.74 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0100  ribonucleotide reductase stimulatory protein  31.03 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0520  ribonucleotide reductase stimulatory protein  31.25 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.295884  normal  0.147892 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0178  NrdI protein  32.53 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0378  nrdI protein  31.33 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3154  ribonucleotide reductase stimulatory protein  32.86 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00169031  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0419  ribonucleotide reductase stimulatory protein  29.55 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0680804  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3112  ribonucleotide reductase stimulatory protein  33.82 
 
 		 136 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2923  ribonucleotide reductase stimulatory protein  33.82 
 
 		 136 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2954  ribonucleotide reductase stimulatory protein  33.82 
 
 		 136 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0571032  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2989  ribonucleotide reductase stimulatory protein  33.82 
 
 		 136 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3006  ribonucleotide reductase stimulatory protein  33.82 
 
 		 136 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316794 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0315  ribonucleotide reductase stimulatory protein  30.86 
 
 		 135 aa  40.4  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560597  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0291  ribonucleotide reductase stimulatory protein  30.86 
 
 		 135 aa  40.4  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0933755  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2357  NrdI protein  34.72 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>