10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5499 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5499  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1741  hypothetical protein  46.84 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000197568 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4516  hypothetical protein  43.9 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00768268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1089  hypothetical protein  46.67 
 
 		 160 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4323  hypothetical protein  45.9 
 
 		 163 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1130  hypothetical protein  46.67 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409178  normal  0.778652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1118  hypothetical protein  43.55 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2701  hypothetical protein  30.91 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3128  response regulator receiver protein  35.53 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0126  hypothetical protein  26.67 
 
 		 190 aa  42.4  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>