29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0064 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0064  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2267  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  63.07 
 
 		 344 aa  329  3e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0191  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  60.34 
 
 		 383 aa  294  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0042  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  48.79 
 
 		 291 aa  281  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2241  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  41.89 
 
 		 248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0213  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  43.6 
 
 		 245 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3932  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.43 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3438  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.32 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425893 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1241  putative carboxypeptidase  34.26 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3580  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  39.39 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07971  putative carboxypeptidase  32.38 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.999242 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0165  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  31.43 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1238  putative carboxypeptidase  33.96 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.588362  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4445  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  35.92 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.585911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16751  putative carboxypeptidase  33.33 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1672  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  34.26 
 
 		 241 aa  52.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10021  putative carboxypeptidase  29.41 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.127155 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1196  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32 
 
 		 244 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206054 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1968  peptidase  31.93 
 
 		 187 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1902  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.93 
 
 		 202 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2828  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.96 
 
 		 246 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3270  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.96 
 
 		 246 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08231  putative carboxypeptidase  29.81 
 
 		 237 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08211  putative carboxypeptidase  28.71 
 
 		 182 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0769  putative carboxypeptidase  28.71 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3298  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  43.18 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1934  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  41.3 
 
 		 239 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.3783  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3005  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  42.55 
 
 		 243 aa  43.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014963  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08221  putative carboxypeptidase  28.71 
 
 		 243 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>