24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0918 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0918  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  177  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.697502  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3713  hypothetical protein  30.38 
 
 
88 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000213543  hitchhiker  0.00129495 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2593  hypothetical protein  27.85 
 
 
88 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00140819  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3490  hypothetical protein  27.85 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000408093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0281  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2940  hypothetical protein  30.38 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000039404  normal  0.0192635 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0224  hypothetical protein  34.57 
 
 
102 aa  43.5  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0188  hypothetical protein  33.33 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0239865  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0182  hypothetical protein  33.33 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3154  hypothetical protein  26.58 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000128266  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1163  hypothetical protein  24.05 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4879  protein of unknown function DUF493  36.14 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0316  hypothetical protein  32.53 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.802626  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0990  hypothetical protein  25.32 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000075069  normal  0.687839 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2874  hypothetical protein  24.05 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000389579  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0986  hypothetical protein  25.32 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105204  normal  0.0165558 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1051  hypothetical protein  25.32 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000671726  hitchhiker  0.00478592 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0364  hypothetical protein  34.94 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.395304 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0500  protein of unknown function DUF493  35.23 
 
 
89 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0729827 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0472  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.439852  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3322  hypothetical protein  22.78 
 
 
88 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000559481  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3458  hypothetical protein  22.78 
 
 
88 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00375963  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3280  hypothetical protein  22.78 
 
 
88 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000870695  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1087  hypothetical protein  22.78 
 
 
88 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000786654  hitchhiker  0.0000064685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>