10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1707 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1707  hypothetical protein  100 
 
 		 699 aa  1412    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0061  hypothetical protein  35.3 
 
 		 588 aa  317  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0895  putative transmembrane protein  31.62 
 
 		 571 aa  242  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0170  hypothetical protein  30 
 
 		 567 aa  211  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.925369  normal  0.490181 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3787  putative transmembrane protein  29.49 
 
 		 570 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513633  normal  0.514979 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0131  hypothetical protein  34.15 
 
 		 581 aa  97.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000619516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1341  hypothetical protein  23.98 
 
 		 616 aa  96.3  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.100096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5102  hypothetical protein  28.57 
 
 		 564 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.992702  normal  0.44393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1674  hypothetical protein  28.62 
 
 		 603 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0284066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1349  hypothetical protein  25.72 
 
 		 580 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0362113 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>