10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0895 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3787  putative transmembrane protein  66.73 
 
 		 570 aa  746    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513633  normal  0.514979 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0895  putative transmembrane protein  100 
 
 		 571 aa  1138    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0170  hypothetical protein  53.83 
 
 		 567 aa  550  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.925369  normal  0.490181 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1707  hypothetical protein  32.38 
 
 		 699 aa  221  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0061  hypothetical protein  30.24 
 
 		 588 aa  196  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1341  hypothetical protein  22.83 
 
 		 616 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.100096 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2544  hypothetical protein  27.59 
 
 		 571 aa  70.5  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146923  normal  0.0442965 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1674  hypothetical protein  24.46 
 
 		 603 aa  66.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0284066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5102  hypothetical protein  24.72 
 
 		 564 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.992702  normal  0.44393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1349  hypothetical protein  19.11 
 
 		 580 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0362113 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>