20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0857 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0857  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  307  5e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  41.18 
 
 
436 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2900  protein of unknown function DUF107  41.72 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0230935  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1193  protein of unknown function DUF107  36.24 
 
 
458 aa  95.1  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0874985  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1632  hypothetical protein  33.96 
 
 
235 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1666  hypothetical protein  33.96 
 
 
235 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0766  protein of unknown function DUF107  35.25 
 
 
423 aa  85.1  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0326  protein of unknown function DUF107  32.3 
 
 
206 aa  84  8e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0124428  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0391  protein of unknown function DUF107  30.82 
 
 
452 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2227  protein of unknown function DUF107  37.14 
 
 
424 aa  77  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.46745  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1818  hypothetical protein  37.86 
 
 
424 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163142  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1141  hypothetical protein  37.14 
 
 
236 aa  74.7  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0392  protein of unknown function DUF107  31.69 
 
 
170 aa  72  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2489  hypothetical protein  41.25 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  40.48 
 
 
447 aa  62.4  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2844  serine protease, ClpP class  25.75 
 
 
407 aa  60.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0730  protein of unknown function DUF107  25.52 
 
 
828 aa  54.7  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.553992  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0019  hypothetical protein  37.5 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000207386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0020  hypothetical protein  29.22 
 
 
488 aa  48.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0144278  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0619  hypothetical protein  30.97 
 
 
443 aa  47.8  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.857657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>