25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1141 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1141  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  461  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1632  hypothetical protein  71 
 
 
235 aa  317  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1666  hypothetical protein  71 
 
 
235 aa  317  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  34.11 
 
 
436 aa  125  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1193  protein of unknown function DUF107  32.27 
 
 
458 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0874985  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0766  protein of unknown function DUF107  32.88 
 
 
423 aa  94  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  30.19 
 
 
447 aa  82.8  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0326  protein of unknown function DUF107  31.05 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0124428  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2227  protein of unknown function DUF107  31.48 
 
 
424 aa  79  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.46745  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2900  protein of unknown function DUF107  34.42 
 
 
158 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0230935  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1818  hypothetical protein  29.82 
 
 
424 aa  77.8  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163142  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0857  hypothetical protein  30.82 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0730  protein of unknown function DUF107  26.56 
 
 
828 aa  75.5  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.553992  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2844  serine protease, ClpP class  26.91 
 
 
407 aa  73.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0391  protein of unknown function DUF107  24.63 
 
 
452 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2489  hypothetical protein  34.88 
 
 
171 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0392  protein of unknown function DUF107  26 
 
 
170 aa  60.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0619  hypothetical protein  28.07 
 
 
443 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.857657  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2106  protein of unknown function DUF107  23.66 
 
 
510 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.420737 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0019  hypothetical protein  34.18 
 
 
158 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000207386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0020  hypothetical protein  26.69 
 
 
488 aa  46.2  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0144278  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2913  hypothetical protein  25 
 
 
423 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  21.21 
 
 
464 aa  43.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  26.67 
 
 
433 aa  43.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2129  hypothetical protein  27.97 
 
 
496 aa  41.6  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>