13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7126 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7126  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 288 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4335  hypothetical protein  54.58 
 
 		 284 aa  298  9e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.723653  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.67 
 
 		 296 aa  290  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64382  normal  0.755088 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0867  permease  40.79 
 
 		 284 aa  199  5e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0084  hypothetical protein  41.99 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.773078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0091  hypothetical protein  41.28 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1090  integral membrane protein  39.21 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0109  hypothetical protein  39.93 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0476827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0202  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.99 
 
 		 285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251862  normal  0.467079 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12723  hypothetical protein  28.85 
 
 		 256 aa  99.4  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2510  hypothetical protein  26.19 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1431  hypothetical protein  27.84 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.185766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2483  membrane protein containing DUF6  25.55 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.886177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>