13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0084 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0084  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  548  1e-155  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.773078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0091  hypothetical protein  93.62 
 
 		 282 aa  464  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0109  hypothetical protein  67.35 
 
 		 294 aa  345  5e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0476827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0867  permease  43.43 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1090  integral membrane protein  40.57 
 
 		 277 aa  214  9e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7126  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.35 
 
 		 288 aa  211  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4335  hypothetical protein  39.58 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.723653  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.98 
 
 		 296 aa  172  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64382  normal  0.755088 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0202  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.71 
 
 		 285 aa  126  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251862  normal  0.467079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1431  hypothetical protein  26.57 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.185766 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2510  hypothetical protein  28.04 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12723  hypothetical protein  30.77 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2483  membrane protein containing DUF6  23.96 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.886177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>