11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1161 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1161  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  204  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0699  Septum formation initiator  52.94 
 
 		 99 aa  97.4  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.785798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5031  hypothetical protein  35.48 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4374  Septum formation initiator  33.71 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0012  septum formation initiator  38.71 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3132  hypothetical protein  36.25 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.185544  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07145  uridine kinase  40.7 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2004  Septum formation initiator  43.24 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1689  Septum formation initiator  32 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0310  Septum formation initiator  36.05 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000820228  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1971  hypothetical protein  31 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>