19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3800 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3800  DRTGG domain-containing protein  100 
 
 
116 aa  236  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000241054  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0333  hypothetical protein  54.55 
 
 
117 aa  130  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2147  hypothetical protein  55.86 
 
 
117 aa  121  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0910  DRTGG domain protein  53.57 
 
 
119 aa  121  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1290  hypothetical protein  54.05 
 
 
117 aa  120  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0180  hypothetical protein  47.32 
 
 
116 aa  116  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0690  hypothetical protein  42.73 
 
 
120 aa  102  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0091  DRTGG domain protein  47.37 
 
 
130 aa  87  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0978121  hitchhiker  0.00135297 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1428  DRTGG domain-containing protein  37.84 
 
 
116 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1474  DRTGG domain-containing protein  36.94 
 
 
116 aa  77.8  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0914  DRTGG domain, putative  36.75 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1908  hypothetical protein  34.23 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0913  hypothetical protein  32.97 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1337  hypothetical protein  31.13 
 
 
118 aa  53.5  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0094  HPr kinase  24.11 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000248452 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0336  DRTGG domain-containing protein  26.26 
 
 
109 aa  43.5  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0177  iron-sulfur binding hydrogenase  24.51 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1268  CBS domain-containing protein  20.75 
 
 
432 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1293  hypothetical protein  25.68 
 
 
116 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>