23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0333 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0333  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  238  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2147  hypothetical protein  58.77 
 
 
117 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1290  hypothetical protein  59.46 
 
 
117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3800  DRTGG domain-containing protein  54.55 
 
 
116 aa  130  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000241054  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0180  hypothetical protein  44.55 
 
 
116 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0690  hypothetical protein  41.82 
 
 
120 aa  107  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0910  DRTGG domain protein  44.35 
 
 
119 aa  107  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0914  DRTGG domain, putative  43.86 
 
 
130 aa  93.6  8e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1428  DRTGG domain-containing protein  43.64 
 
 
116 aa  92  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1474  DRTGG domain-containing protein  42.73 
 
 
116 aa  91.3  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0091  DRTGG domain protein  45.3 
 
 
130 aa  85.1  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0978121  hitchhiker  0.00135297 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1908  hypothetical protein  39.09 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1337  hypothetical protein  35.09 
 
 
118 aa  67  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0913  hypothetical protein  36.94 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1476  hypothetical protein  29.09 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0094  HPr kinase  28.18 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000248452 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0336  DRTGG domain-containing protein  35.19 
 
 
109 aa  54.7  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1430  hypothetical protein  26.92 
 
 
103 aa  51.2  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0177  iron-sulfur binding hydrogenase  29.13 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0913  hypothetical protein  30 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0803  hypothetical protein  28.09 
 
 
110 aa  43.5  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0693  HPr kinase  24.55 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3797  hypothetical protein  23.58 
 
 
115 aa  40.4  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>