50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0120 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0120  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
71 aa  140  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000378265  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1545  Heavy metal transport/detoxification protein  47.14 
 
 
72 aa  76.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.037559  normal  0.0405877 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0235  Heavy metal transport/detoxification protein  49.3 
 
 
72 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000621262  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1064  hypothetical protein  48.57 
 
 
80 aa  72  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.913823 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0433  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
786 aa  69.7  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1614  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1276  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
786 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.248068  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2558  Heavy metal transport/detoxification protein  43.66 
 
 
72 aa  66.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778008  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13750  hypothetical protein  42.86 
 
 
72 aa  66.6  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05930  hypothetical protein  43.28 
 
 
72 aa  63.9  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.720927 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0512  heavy metal translocating P-type ATPase  40.58 
 
 
785 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0595  heavy metal-transporting ATPase  38.24 
 
 
788 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0564  heavy metal-transporting ATPase  38.24 
 
 
788 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0652  heavy metal-transporting ATPase  36.76 
 
 
788 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329605 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0508  cation-transporting ATPase, P-type  36.76 
 
 
788 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0506  cation-transporting ATPase, P-type  36.76 
 
 
788 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.907696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0663  heavy metal-transporting ATPase  36.76 
 
 
788 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0634  heavy metal-transporting ATPase  36.76 
 
 
788 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.373732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4704  heavy metal-transporting ATPase  36.76 
 
 
788 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0990671 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0723  heavy metal-transporting ATPase  36.76 
 
 
788 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0510  cadmium-translocating P-type ATPase  37.68 
 
 
784 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0314  heavy metal translocating P-type ATPase  32.26 
 
 
695 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.040905  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1409  Heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 
74 aa  48.9  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0770  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
699 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2203  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
700 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.588592 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0244  heavy metal translocating P-type ATPase  38.57 
 
 
707 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.787519  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  30.16 
 
 
744 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0927  heavy metal translocating P-type ATPase  30.16 
 
 
800 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.28162  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0336  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 
690 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1742  cadmium-translocating P-type ATPase  31.43 
 
 
773 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.106711  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  33.82 
 
 
815 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  38.33 
 
 
735 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3236  E1-E2 ATPase-associated domain-containing protein  30.19 
 
 
344 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  26.98 
 
 
743 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4789  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  36.21 
 
 
732 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3853  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  36.21 
 
 
732 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3752  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  36.21 
 
 
732 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  40.48 
 
 
976 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0247  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  36.21 
 
 
732 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03318  zinc, cobalt and lead efflux system  36.21 
 
 
732 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  28.89 
 
 
712 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3668  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  36.21 
 
 
732 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03271  hypothetical protein  36.21 
 
 
732 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3951  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  36.21 
 
 
732 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0246  heavy metal translocating P-type ATPase  36.21 
 
 
732 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5561  P type cation (metal) transporter ATPase component  32.73 
 
 
757 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.85793  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0421  heavy metal translocating P-type ATPase  32.86 
 
 
721 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.403796  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  28.89 
 
 
711 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  32.73 
 
 
904 aa  40.8  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7421  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  34.09 
 
 
764 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.396456 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>