13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0562 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0562  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  337  4e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.261919  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01675  hypothetical protein  56.03 
 
 
128 aa  135  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0877  hypothetical protein  41.62 
 
 
151 aa  124  9e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000608823  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1594  hypothetical protein  50.56 
 
 
123 aa  108  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0628  hypothetical protein  51.65 
 
 
120 aa  100  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0197  hypothetical protein  41.11 
 
 
122 aa  77.4  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.235758 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0968  hypothetical protein  33.61 
 
 
139 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000628475  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7301  hypothetical protein  33.66 
 
 
127 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1671  hypothetical protein  28.57 
 
 
121 aa  53.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.245039  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0531  hypothetical protein  28.18 
 
 
118 aa  48.5  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370259  normal  0.29501 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3583  hypothetical protein  28.57 
 
 
116 aa  48.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.844897  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1387  hypothetical protein  34.69 
 
 
122 aa  48.1  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.453684  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26100  predicted protein  32.1 
 
 
1646 aa  40.8  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.490738  normal  0.061037 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>