20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0462 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0462  RNA polymerase Rpb6  100 
 
 		 104 aa  208  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.163719 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1772  DNA-directed RNA polymerase subunit K  58.75 
 
 		 110 aa  100  8e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000021326 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1703  DNA-directed RNA polymerase subunit K  56.25 
 
 		 109 aa  98.2  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.639739  normal  0.399247 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0502  DNA-directed RNA polymerase subunit K  55 
 
 		 109 aa  94  6e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.982464  normal  0.408765 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1524  DNA-directed RNA polymerase subunit K  65.62 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.951161  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1888  RNA polymerase Rpb6  43.06 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216577  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0290  RNA polymerase Rpb6  45.21 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.030804  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1673  DNA-directed RNA polymerase, subunit K  42.42 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0083987  normal  0.431934 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_8797  predicted protein  38.03 
 
 		 81 aa  50.8  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.76808  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60409  subunit common to RNA polymerases I, II, and III  38.03 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.7613 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10148  predicted protein  37.68 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.313953  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02747  DNA-directed RNA polymerase I, II, and III subunit Rpb6 (AFU_orthologue; AFUA_1G05160)  39.39 
 
 		 198 aa  48.5  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0516525  normal  0.594971 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01770  DNA-directed RNA polymerases I, II, and III polypeptide, putative  40.85 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.201814  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2380  RNA polymerase Rpb6  44.44 
 
 		 56 aa  45.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000413044  normal  0.621236 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0932  RNA polymerase Rpb6  42.86 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186024 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1424  DNA-directed RNA polymerase, subunit K  40.74 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0159799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2894  RNA polymerase Rpb6  40.74 
 
 		 55 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.003737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2546  RNA polymerase Rpb6  41.51 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0479  RNA polymerase Rpb6  37.74 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2217  RNA polymerase Rpb6  40.74 
 
 		 57 aa  40.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>