17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2388 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2388  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  510  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1987  hypothetical protein  58.8 
 
 		 247 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0064  putative hypothetical Gifsy-1 prophage protein  46.61 
 
 		 135 aa  105  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.358866  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0089  Gifsy-1 prophage protein  46.43 
 
 		 135 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0742  Gifsy-1 prophage protein  40 
 
 		 134 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.235279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2032  Gifsy-1 prophage protein  40 
 
 		 134 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.867153  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2007  hypothetical protein  34.62 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0465  hypothetical protein  29.81 
 
 		 134 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01163  hypothetical protein  29.32 
 
 		 133 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0191677  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1278  pre-peptidase C-terminal domain-containing protein  29.32 
 
 		 133 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000332318  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01153  hypothetical protein  29.32 
 
 		 133 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.028081  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2447  peptidase domain-containing protein  29.32 
 
 		 133 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000454927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2817  pre-peptidase C- domain protein  27.07 
 
 		 133 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.153946 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1322  pre-peptidase C-terminal domain-containing protein  30.08 
 
 		 133 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000328338  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1663  pre-peptidase C-terminal domain protein  30.08 
 
 		 133 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000320057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1971  pre-peptidase C-terminal domain-containing protein  30.3 
 
 		 133 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000018944  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2470  peptidase domain protein  30.08 
 
 		 133 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00513747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>