12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1046 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  96.8 
 
 		 1062 bp  1834    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1046    100 
 
 		 1064 bp  2109    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.668578  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  95.53 
 
 		 1062 bp  1707    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  79.15 
 
 		 1056 bp  313  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  79.26 
 
 		 1059 bp  276  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  80.31 
 
 		 1059 bp  274  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1073    82.14 
 
 		 489 bp  137  6.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000428725  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1256    89.57 
 
 		 509 bp  133  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  77.37 
 
 		 1068 bp  127  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  77.37 
 
 		 1068 bp  127  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  95 
 
 		 1023 bp  63.9  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  87.5 
 
 		 1074 bp  56  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>