16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0843 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0843  conserved hypothetical protein (DUF1353 domain protein)  100 
 
 		 123 aa  250  4.0000000000000004e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292478  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0229  hypothetical protein  59.02 
 
 		 123 aa  168  3e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.942567  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0594  hypothetical protein  60.98 
 
 		 124 aa  164  5e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1448  hypothetical protein  60.16 
 
 		 124 aa  160  7e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.646721  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1148  hypothetical protein  59.5 
 
 		 126 aa  154  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.0000000000012989  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0023  hypothetical protein  48.62 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0126693  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1182  hypothetical protein  41.41 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.51944  normal  0.653749 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1324  hypothetical protein  46.15 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0693  hypothetical protein  38.55 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1881  hypothetical protein  43.42 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00249021  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3824  hypothetical protein  42.11 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0940  hypothetical protein  37.14 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0158947  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3602  protein of unknown function DUF1353  33.33 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2242  hypothetical protein  38.46 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.221816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3096  hypothetical protein  29.17 
 
 		 230 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1858  hypothetical protein  32.67 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572747  unclonable  3.75184e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>