21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1324 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1324  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  261  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1182  hypothetical protein  72.5 
 
 
130 aa  187  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.51944  normal  0.653749 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2242  hypothetical protein  64.96 
 
 
124 aa  167  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.221816 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1881  hypothetical protein  47.32 
 
 
139 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00249021  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0940  hypothetical protein  48.51 
 
 
139 aa  104  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0158947  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3824  hypothetical protein  51.04 
 
 
139 aa  104  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1858  hypothetical protein  36.8 
 
 
126 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572747  unclonable  3.75184e-16 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0693  hypothetical protein  46.05 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0843  conserved hypothetical protein (DUF1353 domain protein)  46.15 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292478  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1448  hypothetical protein  39.24 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.646721  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4690  hypothetical protein  44.09 
 
 
245 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0023  hypothetical protein  40.7 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0126693  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0594  hypothetical protein  39.24 
 
 
124 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0229  hypothetical protein  35.9 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.942567  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1148  hypothetical protein  36.7 
 
 
126 aa  53.9  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.0000000000012989  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3602  protein of unknown function DUF1353  35.14 
 
 
261 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3096  hypothetical protein  31.31 
 
 
230 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495233  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1653  hypothetical protein  35.8 
 
 
115 aa  44.3  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.53128  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1607  hypothetical protein  35.8 
 
 
115 aa  44.3  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000144684  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0823  hypothetical protein  35.44 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00716982  normal  0.247171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2204  hypothetical protein  29.81 
 
 
108 aa  40  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.145756  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>