36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1960 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1960  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  303  6e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.311807  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03817  protein YjbJ  36.07 
 
 		 63 aa  47.8  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1194  CsbD-like  32.79 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1196  CsbD-like  32.79 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0795  CsbD family protein  30.3 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2250  hypothetical protein  33.33 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0156  hypothetical protein  28.12 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.232255  hitchhiker  0.0000211903 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1771  CsbD family protein  33.33 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4008  CsbD-like  33.33 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0235729  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2651  CsbD-like protein  32.31 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2910  hypothetical protein  33.33 
 
 		 79 aa  43.9  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.912456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1731  CsbD-like  32.2 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.888491  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1391  CsbD family protein  35.85 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4507  putative stress-response protein  31.15 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0166  CsbD-like  26.56 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3411  CsbD family protein  32.76 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5243  CsbD family protein  32.76 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4053  CsbD family protein  34.48 
 
 		 65 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3468  CsbD family protein  34.48 
 
 		 65 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0852  CsbD family protein  30.56 
 
 		 73 aa  42.4  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2288  CsbD family protein  32.76 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2683  hypothetical protein  34.48 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4634  putative stress-response protein  30.65 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.27716 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4497  putative stress-response protein  30.65 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4582  putative stress-response protein  30.65 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4583  putative stress-response protein  30.65 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.808019 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3988  CsbD-like  28.33 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3710  CsbD family protein  30.3 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0369  CsbD family protein  36.07 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4154  CsbD-like  30 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0316  CsbD family protein  30.16 
 
 		 67 aa  41.2  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.179189  hitchhiker  0.0000000572285 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1394  CsbD-like  30.65 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2503  CsbD-like  25.81 
 
 		 91 aa  40.8  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0483582  normal  0.747917 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1175  CsbD-like  29.51 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.577345  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5157  CsbD family protein  31.03 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.461612 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4727  CsbD family protein  31.03 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781625  hitchhiker  0.00687348 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>