22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_t16 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_t16  tRNA-Ser  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0031  tRNA-Ser  96.39 
 
 		 83 bp  141  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0075389 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0015  tRNA-Ser  95.18 
 
 		 86 bp  133  6.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0037  tRNA-Ser  95.18 
 
 		 83 bp  133  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0032  tRNA-Ser  95.18 
 
 		 86 bp  133  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.743762  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0037  tRNA-Ser  93.98 
 
 		 83 bp  125  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.32167  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0040  tRNA-Ser  93.98 
 
 		 83 bp  125  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0012  tRNA-Ser  88.33 
 
 		 83 bp  63.9  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  8.82473e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t40  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0037  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.182504  normal  0.716043 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341382  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0822  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0044  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA47  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.276282 
 
 
-
 
NC_003295  RS01508  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0059  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.98639 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25970  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0048  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0015  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0013  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.694217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>