15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3677 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3677  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 116 aa  240  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  34.09 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3106  hypothetical protein  36.26 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637865 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0973  hypothetical protein  31.73 
 
 		 109 aa  48.9  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.784027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2923  hypothetical protein  32.26 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.373188 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2870  hypothetical protein  33.68 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.294622  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1592  hypothetical protein  33.68 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0338117  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5662  hypothetical protein  34.26 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.340656 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1329  hypothetical protein  30.77 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4237  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2349  hypothetical protein  41.67 
 
 		 109 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.17 
 
 		 121 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  32.1 
 
 		 202 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2105  hypothetical protein  37.29 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0449217  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1781  hypothetical protein  36.67 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.670787  normal  0.597346 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>