14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3017 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3017  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  276  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196092  normal  0.052376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6261  hypothetical protein  45.38 
 
 
160 aa  94  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1753  hypothetical protein  37.9 
 
 
149 aa  73.6  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3177  hypothetical protein  36.15 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3592  hypothetical protein  35.94 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4940  hypothetical protein  36.11 
 
 
173 aa  55.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000844553  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1518  hypothetical protein  23.13 
 
 
151 aa  52  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00559169 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3920  hypothetical protein  26.56 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.879955  normal  0.416027 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0329  hypothetical protein  30.83 
 
 
130 aa  47.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00304499  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3107  hypothetical protein  34.81 
 
 
157 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000543353  decreased coverage  0.0000114562 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0418  hypothetical protein  47.5 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0412  hypothetical protein  33.01 
 
 
817 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1551  hypothetical protein  30.08 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3755  hypothetical protein  27.21 
 
 
226 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.473381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>