14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1172 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1172  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  558  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743976  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0738  hypothetical protein  65.3 
 
 
272 aa  354  7.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3235  hypothetical protein  68.63 
 
 
276 aa  346  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106769  normal  0.244789 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4103  hypothetical protein  63.47 
 
 
286 aa  342  5e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1842  hypothetical protein  56.93 
 
 
267 aa  296  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1640  hypothetical protein  44.48 
 
 
282 aa  246  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4401  putative membrane-associated metal-dependent hydrolase  37.83 
 
 
291 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.483513  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4223  putative membrane-associated metal-dependent hydrolase  38.4 
 
 
291 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4244  putative membrane-associated, metal-dependent hydrolase  38.4 
 
 
291 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01331  hypothetical protein  28.2 
 
 
972 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1520  Methyltransferase type 11  25.35 
 
 
492 aa  79  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.675852  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1102  sulfatase  22.64 
 
 
506 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0852605  normal  0.561012 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2507  sulfatase  25 
 
 
873 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0936334  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3685  sulfatase  28.36 
 
 
1009 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0329595  hitchhiker  0.00309505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>