15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2775 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2775  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  238  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.127465  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4064  hypothetical protein  44.33 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2448  hypothetical protein  35.79 
 
 		 108 aa  60.1  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.907698  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08041  hypothetical protein  32.32 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.343317  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0634  hypothetical protein  37.25 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.150963  normal  0.256689 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3975  hypothetical protein  28.85 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1129  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1157  hypothetical protein  30 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5362  hypothetical protein  28.16 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.284993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0694  hypothetical protein  36.78 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000357098  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0768  hypothetical protein  34.48 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000286376  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_674  hypothetical protein  34.48 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000147632  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1575  hypothetical protein  26.67 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0789  hypothetical protein  35.35 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0854  hypothetical protein  27.84 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>